潔凈室需要控管的項目包括溫度、濕度、靜壓差、風速、微粒、浮游菌、沉降菌， 當然在設計之初還有噪音、光照度、 安全、節(jié)能等方面的考慮。對于使用者來說使用過程中學會日常監(jiān)測非常重要， 這是保證教學科研工作的前提之一， 也有利于在出現(xiàn)異常數(shù)據(jù)時排查原因。

溫度、濕度、靜壓差、風速是預測試指標， 只有這些指標都在規(guī)定范圍內(nèi)， 后續(xù)3個主測試指標的監(jiān)測才有意義。溫濕度要求使用者可以自己把握， 如無特殊要求時， 溫度在18～26℃， 相對濕度在45%～65%為宜。潔凈室與非潔凈室之間的靜壓差應>10 Pa;相鄰不同潔凈級別的潔凈室之間的壓差應>0.5 Pa;潔凈區(qū)與室外壓差應>12 Pa。單向流凈室實測室內(nèi)平均風速應大于設計風速， 但不應超過15%。以上測試可以通過溫濕度儀、微壓計、風速儀來完成。

懸浮粒子測試可以通過微粒計數(shù)儀來完成。監(jiān)測時首先用面積開根號的方法確定最少采樣點數(shù)目， 學校生物實驗室都比較小， 一般每間3～4個點就夠了， 采樣時需注意采樣點在室內(nèi)均勻分布并盡量避開回風口， 采樣管口應正對氣流方向， 高度約離地80 cm， 測試人員應在采樣口的下風側， 并盡量減少活動。為保證儀器下次能正常使用， 采樣完畢一定啟動儀器的自凈程序。

浮游菌、沉降菌的采樣方法及注意事項同懸浮粒子， 分別通過浮游菌采樣儀及帶有微生物培養(yǎng)基的平皿來完成。培養(yǎng)皿在用于檢測時， 為避免培養(yǎng)皿運輸或搬運過程造成的影響， 宜同時進行陰性對照試驗， 每次或每個區(qū)域取1個對照皿， 與采樣皿同法操作但不需暴露采樣， 然后與采樣后的培養(yǎng)皿一起放入培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)， 結果應無菌落生長。

至于以上指標的監(jiān)測頻率除沉降菌外使用者可以自己把握， 潔凈室啟用之初應每周監(jiān)測， 如果數(shù)據(jù)穩(wěn)定， 適當延長周期， 但建議至少每3個月監(jiān)測1次。每次實驗時超凈臺及潔凈室內(nèi)都應當放置沉降菌平板， 相當于一個實驗環(huán)境的陰性對照， 而對于微生物實驗， 尤其是細菌總數(shù)， 只有在監(jiān)測數(shù)據(jù)符合對應等級的潔凈室要求時數(shù)據(jù)才有效。